en

Ученые создали программу, которая быстро находит родственные участки геномов разных животных



Ученые создали программу, которая быстро находит родственные участки геномов разных животных

Международная группа учёных, в которую вошли представители Университета ИТМО, создала программный инструмент, который позволяет быстро и эффективно находить похожие участки в геномах разных животных. Это необходимо чтобы понять, насколько два вида близки друг к другу и насколько далеко они отошли в ходе эволюции от общего предка. 

От Университета ИТМО в данном исследовании приняли участие сотрудница Научно-образовательного центра геномного разнообразия (https://news.itmo.ru/ru/science/it/news/9233/) - Ксения Крашенинникова и руководитель данного центра - Стивен О'Брайэн.  

Суть созданной программы заключается в том, что она анализирует результаты сравнения (выравнивания) пары геномов и ищет протяженные фрагменты, которые обладают некоторой степенью сходства. 

Данная программа принципиально важна потому что при сравнении двух и более геномов между собой, одним из этапов анализа является поиск фрагментов которые похожи друг на друга. Похожесть геномных последовательностей у двух разных организмов (между кошкой и собакой, например) чаще всего означает, что эти два фрагмента были унаследованы от общего предка. Подобная информация необходима для понимания эволюции организма.

Разработанная программа является одной из самых быстрых и точных, что есть на текущий момент, при этом она работает с двумя наиболее популярными современными форматами хранения геномных выравниваний.  

Работа учёных опубликована в журнале GigaScience: https://academic.oup.com/gigascience/article/9/6/giaa047/5848161

Полный текст статьи читайте на новостном портале ITMO.NEWS: https://news.itmo.ru/ru/science/it/news/9511/